Το Εργαστήριο, μεταξύ άλλων, έχει διοργανώσει ή/ και συμμετάσχει στην διοργάνωση των εξής συνεδρίων και ημερίδων:

1. 2ο Πανελλήνιο Συνέδριο "Η συμβολή της Ιστορίας και Φιλοσοφίας των Φυσικών Επιστημών στη Διδασκαλία των Φυσικών Επιστημών” (8-11 Μαΐου 2003, Αθήνα).
2. Σεμινάριο: "Ριζοσπαστικές Προσεγγίσεις της Επιστήμης και Ιστορία των Επιστημών” (6-8 Ιουλίου 2004, Ερμούπολη, Σύρος)
3. Σεμινάριο: "Επιστήμες και Κοινωνική Δικαιοσύνη” (28-30 Ιουνίου 2005, Ερμούπολη, Σύρος)
4. 3ο Πανελλήνιο Συνέδριο: "Ιστορία, Φιλοσοφία & Διδασκαλία των Φυσικών Επιστημών” (19-25 Σεπτεμβρίου 2005, Αθήνα)
5. European Physical Society Conference "Notions of Physics in Natural Philosophy” (23-25 Σεπτεμβρίου 2005, Αθήνα)
6. Εκλαϊκευτική Σειρά Παρουσιάσεων/ συζητήσεων «Ανοιχτές Πόρτες» με θέμα «Το έργο του Einstein και άλλα θέματα Σύγχρονης Φυσικής» (16&30 Μαρτίου και 20 Απριλίου 2005) σε συνεργασία με την Ένωση Ελλήνων Φυσικών και «Στοιχειώδη Σωματίδια» ομιλία Ν. Τράκα, καθηγητή Ε.Μ.Π (Πρόγραμμα Science on Stage, 11 Μαίου 2005).
7. Ημερίδα για "Θέματα Διδακτικής Βιολογίας στην Πρωτοβάθμια και Δευτεροβάθμια Εκπαίδευση” με ομιλητές τους G. Carvalho (University of Minho, Πορτογαλία) & P.Clement (University Lyon 1, Γαλλία) (5 Δεκεμβρίου 2005, Αθήνα)
8. Ημερίδα: "Περιβαλλοντική Εκπαίδευση και ο ρόλος των Μουσείων” σε συνεργασία με το Μουσείο Γουλανδρή Φυσικής Ιστορίας, Κέντρο ΓΑΙΑ (28 Μαΐου 2006, Αθήνα)
9. Σεμινάριο: "Ριζοσπαστικές Προσεγγίσεις στις Επιστήμες και στην Εκπαίδευση” (10-12 Ιουλίου 2006, Ερμούπολη, Σύρος)
10. Ζ’ Πανελλήνιο Συνέδριο: «Έρευνα και Εκπαίδευση στις Φυσικές Επιστήμες στα Παιδαγωγικά Τμήματα Δημοτικής Εκπαίδευσης», του Τομέα Φυσικών Επιστημών, Τεχνολογίας και Περιβάλλοντος του Π.Τ.Δ.Ε., σε συνεργασία με το Κέντρο Έρευνας Επιστήμης και Εκπαίδευσης (11 - 13 Μαΐου 2007, Αθήνα).
11. 4η Συνάντηση Εργασίας:«Κριτικές προσεγγίσεις στις επιστήμες και την εκπαίδευση» (18-22 Ιουλίου 2007, Ελάτη Τρικάλων)
12. 4η Συνάντηση Αθηνών «Ζητήματα Επιστήμης: Ιστορία, Φιλοσοφία και Διδακτική» (28-30 Σεπτεμβρίου 2007, Αθήνα)
13. Διοργάνωση έντεκα (11) επιμορφωτικών σεμιναρίων (επίπεδα Π3 και Π4) με θέμα "Νέες Τεχνολογίες και Περιβαλλοντική Εκπαίδευση" ως συμμετοχή στο πρόγραμμα «Επιμόρφωση Εκπαιδευτικών και Στελεχών Περιβαλλοντικής Εκπαίδευσης», που υλοποίησε στο πλαίσιο του ΕΠΕΑΕΚ ΙΙ το Εθνικό Μετσόβιο Πολυτεχνείο (12/2007-5/2008) στην Αθήνα
14. 5η Συνάντηση Εργασίας:«Κριτικές προσεγγίσεις στις επιστήμες και την εκπαίδευση» (14-20 Ιουλίου 2008, Ελάτη Τρικάλων)
15. 6η Συνάντηση Εργασίας:"Κριτικές προσεγγίσεις στις επιστήμες και τη εκπαίδευση" (14-17 Ιουλίου 2009, Ελάτη Τρικάλων)
16. Πανελλήνιο Συνέδριο "Ιστορία, Φιλοσοφία και Διδακτική των Επιστημών (6-9 Μαΐου 2010, Αθήνα)